喀西王朝在公元前1570年左右征服了巴比伦，大约在公元前1595年巴比伦被赫梯人征服25年之后，为了纪念库里加尔祖一世(约公元前14世纪早期)，他们将巴比伦改名为“卡尔-杜尼什”。

他们的统治持续了576年，是巴比伦历史上最长的王朝。

由于缺乏这段所谓的“黑暗时代”时期的记录，他们掌权的具体情况尚不清楚。没有任何喀西特语的铭文或文件被保存下来，这种缺失不可能纯粹是偶然的，这表明官方识字率严重下降。在喀西特统治者的统治下，巴比伦作为政治和军事力量重新出现在美索不达米亚。

他们的成功建立在喀西特君主所取得的相对政治稳定之上。南美索不达米亚转变为一个领土国家，而不是一个由联盟或好战的城市国家组成的网络，这使巴比伦成为一个国际强国，尽管它经常被其北部邻国亚述和东部的埃兰所掩盖.

喀西特国王建立了与亚述的贸易和外交关系。公元前16世纪中期，亚述的普祖尔-阿舒尔三世和伯纳-布里亚什一世签署了一项条约，就两国之间的边界问题达成一致。埃及人、以拦人、赫人、加西族的王族都与他们的王族通婚。

巴比伦和其他城市有外国商人，从埃及(努比亚黄金的主要来源)到亚述和安纳托利亚，巴比伦商人都很活跃。喀西特的砝码和封条是用来识别和测量商业包裹的工具，在遥远的希腊底比斯、亚美尼亚南部，甚至在今天土耳其南部海岸的一艘沉船中都有发现。

15世纪中期，库里加尔祖一世和亚述的亚舒尔-贝尔-尼舒尔之间达成了进一步的条约。然而，在公元前1365年阿舒尔-乌巴利特一世继位后的几个世纪里，巴比伦发现自己受到了亚述的攻击和统治。阿舒尔-乌巴利特一世使亚述(连同赫梯人和埃及人)成为近东的主要力量。

巴比伦在13世纪60年代被亚述国王阿舒尔-乌巴利特一世(公元前1365年-公元前1330年)洗劫，巴比伦的喀西特国王娶了阿舒尔-乌巴利特的女儿被谋杀。阿舒尔-乌巴利特迅速进军巴比伦，为他的女婿报仇，废黜了国王，立喀西特王室的库里加尔祖二世为国王。

他的继任者伊利尔-尼拉里(公元前1330年至1319年)也进攻巴比伦尼亚，他的曾孙阿达德-尼拉里一世(公元前1307年至1275年)成为国王后吞并了巴比伦的领土。

图库尔提-尼努塔一世(公元前1244年-公元前1208年)并不满足于仅仅统治巴比伦，他更进一步，征服了巴比伦，废黜了卡什提利阿什四世，并在那里统治了8年，从公元前1235年到公元前1227年。

喀西王朝的国王们通过由总督管理的各省网络来控制他们的王国。复苏的尼普尔城是最重要的省级中心。尼普尔，这个曾经伟大的城市，在公元前1730年几乎被废弃，在喀西特时期重建，寺庙在旧的基础上精心重建。

事实上，在喀西政府的统治下，尼普尔的统治者是一个次等的国王。尼普尔的声望足以让公元前13世纪的一系列喀西特国王为自己恢复“尼普尔总督”的头衔。

喀西特时期的其他重要中心是拉尔萨、西帕尔和苏萨。喀西王朝在公元前1155年被推翻后，省行政制度继续存在，国家在随后的伊辛第二王朝的统治下保持统一。

关于喀西特时期的文献很大程度上依赖于来自尼普尔的零散而不连贯的石碑，在那里已经出土了数千块石碑和碎片。它们包括行政和法律文本、信件、印章铭文、库杜鲁(土地赠与和行政法规)、私人祈愿铭文，甚至是文学文本(通常被认定为历史史诗的片段)。

“巴比伦的喀西特统治者也谨慎地遵循现有的表达形式，以及公共和私人的行为模式，甚至超越了这一点——就像狂热的新人们或接受高级文明的外人所做的那样——他们倾向于一种极端保守的态度，至少在皇宫圈子里是这样。”

然而，几个世纪以来，喀西人逐渐融入巴比伦人口。喀西特王朝的最后8位国王都有阿卡德名字，库杜尔-伊利尔的名字有埃兰血统和苏美尔血统，喀西特公主嫁给了亚述王室。

公元前12世纪，埃兰人征服了巴比伦，结束了喀西王朝。最后一个喀西国王，恩利勒-纳丁-阿希，被带到苏萨并囚禁在那里，他也死在那里。喀西王朝在第五王朝(公元前1025年-公元前1004年)确实短暂地重新控制了巴比伦，但他们再次被推翻，这一次是被一个亚兰王朝推翻。

早期铁器时代

埃兰人并没有在巴比伦停留很长时间，马尔杜克-卡比特-哈赫舒(公元前1156年-公元前1139年)在一系列的战争中建立了伊辛的第二王朝(第一个统治巴比伦的南美索不达米亚王朝)，在他的继任者的统治下继续着。

尼布甲尼撒一世(公元前1124年-公元前1103年)是这个王朝最著名的统治者。他打败了埃兰人，把他们赶出了巴比伦的领土，洗劫了埃兰人的首都苏萨，夺回了从巴比伦掠走的马杜克神像。

不久之后，埃兰国王被暗杀，他的王国陷入内战。然而，尼布甲尼撒没能进一步扩大巴比伦的领土，被亚述人王阿舒尔-勒施-希希一世打败，以控制先前赫梯人控制的亚兰(叙利亚)的领土。在他统治的后期，他致力于和平的建筑工程。

尼布甲尼撒的两个儿子继位。他们中的第二个，马尔杜克-纳丁-哈赫(公元前1098年-公元前1081年)与亚述开战。在这些冲突中，一些最初的成功被提格拉-皮列泽一世的惨败所取代，提格拉-皮列泽一世吞并了巴比伦的大片领土。

在这之后，一场可怕的饥荒席卷了巴比伦，引来了来自西方的闪米特亚兰部落的进攻。历代国王明智地与亚述保持和平关系，但无法阻止闪米特游牧民族的反复入侵，巴比伦的大片土地被这些新到达的亚兰人、迦勒底人和苏提人侵占和占领。

在126年后，由纳布-舒姆-利布尔统治的本土王朝被推翻。在公元前1025年到公元前977年之间，巴比伦处于无政府状态，由七个国王被三个外国王朝分割统治着这个国家。

第五王朝(公元前1025年-公元前1004年)是喀西王朝，这个王朝被第六王朝(公元前1003年-公元前984年)和第七王朝(公元前984年-公元前977年)取代，第六王朝是亚兰人，第七王朝是埃兰人。

公元前977年，纳布-穆金-阿普里恢复了当地的统治，迎来了第八王朝。第九王朝始于公元前941年统治的尼努塔-库杜里-乌苏一世。在这一时期，巴比伦仍然很虚弱，整个地区都在迦勒底人、亚兰人和苏泰人的牢牢控制之下。

从公元前911年到阿达德-尼拉里二世建立新亚述帝国，巴比伦发现自己在亚述的统治和统治下持续了三个世纪。巴比伦的领土被亚述兼并，巴比伦的国王被迫向亚述国王进贡。

公元前729年，巴比伦被提格拉特·皮勒泽三世完全纳入亚述帝国，他没有像他的前任那样让巴比伦国王继续作为亚述的附属国存在200年，而是决定自己直接统治。在埃兰人的帮助下，美索不达米亚最东南方的迦勒底国王米罗达-巴拉丹最终发酵了对亚述统治的反抗。

米罗达-巴拉丹在公元前721- 710年间成功地登上了巴比伦的宝座。他被亚述的萨尔贡二世驱逐，逃到埃兰。然而，米罗达巴拉丹和以兰人仍旧站起来反抗亚述人的统治。

这导致了亚述王西拿基立入侵并征服了埃兰，洗劫了巴比伦，使这座城市成为一片废墟。这一行为导致西拿基立在向尼斯洛赫神祈祷时被自己的儿子杀害。

他的继任者以撒哈顿重建了巴比伦，在他死后，他立长子沙沙书乌金为巴比伦王，小儿子亚述巴尼拔为更高的亚述王。

沙马什-舒姆-乌金，在和平地服从了他哥哥几十年之后，最终被灌输了巴比伦的民族主义，宣布巴比伦城(而不是亚述的尼尼微城)应该是帝国的所在地。

他发动了一场起义，反抗他的兄弟亚述巴尼拔。他领导了一个强大的联盟，包括埃兰人、迦勒底人、苏提人、亚兰人和阿拉伯人。经过一场激烈的斗争，巴比伦被洗劫一空，它的盟友也被征服，沙马希-舒姆-乌基姆在这个过程中被杀。

埃兰被摧毁了，迦勒底人、阿拉伯人、亚兰人和苏提人都被暴力征服了。亚述总督坎大拉努登上了王位。公元前627年，亚述巴尼死后，他的儿子亚舒尔-埃提尔-伊拉尼成为巴比伦和亚述的统治者。